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Molecular Modeling (MolMod)5 ECTS (englische Bezeichnung: Molecular Modeling)
(Prüfungsordnungsmodul: Molecular Modeling)
Modulverantwortliche/r: Dirk Zahn Lehrende:
Dirk Zahn, Nico van Eikema Hommes
Startsemester: |
WS 2022/2023 | Dauer: |
2 Semester | Turnus: |
jährlich (WS) |
Präsenzzeit: |
90 Std. | Eigenstudium: |
60 Std. | Sprache: |
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Lehrveranstaltungen:
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Molecular Modelling (WS 2022/2023)
(Vorlesung, 2 SWS, Dirk Zahn et al., Mo, 8:00 - 9:30, CCC 2.206)
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Molecular Modeling PRA (SS 2023)
(Vorlesung mit Übung, 2 SWS, Nico van Eikema Hommes et al., Mo, 12:00 - 17:00, CCC 2.202a, CCC 2.203; Mi, 13:00 - 17:00, CCC 2.202a, CCC 2.203; Fr, 8:00 - 12:00, CCC 2.202a, CCC 2.203; Anmeldung über StudON; für die genaue Zeiten, siehe Stundenplan)
Inhalt:
MM:
Kraftfelder, Molekülmechanik, Molekulardynamik, Einführung in die Modellierung komplexer Systeme. Molekulare Modellierung von Proteinen, Solvatation, Faltung und Protein-Wirkstoff Wechselwirkungen. Konzepte von Hybrid- und Coarse-graining Methoden zur Überwindung von Zeit- und Längenskalen.
Praktikum:
Einführung in Modelling-Techniken und Visualisierung, Durchführung von einfachen Rechnungen und Analyse komplexer Simulationen, Strukturdefinition, -optimierung, Moleküldynamik, Einführung in die praktische Durchführung von Hartree-Fock-Rechnungen und die Anwendung von semiempirischen Methoden, Parametrisierung und Anwendung von Kraftfeldern, Energieprofile, Übergangszustände, Coarse-graining und Hybridmethoden.
Lernziele und Kompetenzen:
Die Studierenden
sind in der Lage Molecular Modeling Programme selbstständig anzuwenden
können auch komplexe Fragestellungen auf geeignete molekulare Modellsysteme übertragen
sind fähig Kraftfeld, Semiempirik, Dichtefunktional- und ab initio Berechnungen selbstständig durchzuführen
sind in der Lage, Moleküldynamische Simulationen durchzuführen, zu analysieren und Gleichgewichtsstrukturen bzw. Übergangszustände zu identifizieren.
Bemerkung:
Verwendbarkeit des Moduls: B.Sc. Molecular Science (Vertiefungsrichtung LIFE Science)
Organisatorisches:
Achtung:
Erstablegung der Klausur erfolgt im Wintersemester, die 1.Wiederholungsmöglichkeit dann im Sommersemester;
Notenverbuchung von Klausurnote und Praktikumsleistungen erfolgt erst im Sommersemester!
Anmeldung bitte auf StudOn, um weitere Informationen zu bekommen!
Verwendbarkeit des Moduls / Einpassung in den Musterstudienplan:
- Molecular Science (Bachelor of Science): 5-6. Semester
(Po-Vers. 2020w | NatFak | Molecular Science (Bachelor of Science) | Vertiefungsmodule | Vertiefung Molecular Life Science | Molecular Modeling)
Studien-/Prüfungsleistungen:
Molecular Modeling (Prüfungsnummer: 20711)
- Prüfungsleistung, Klausur, Dauer (in Minuten): 90, benotet, 5 ECTS
- Anteil an der Berechnung der Modulnote: 100.0 %
- weitere Erläuterungen:
Molecular Modelling: W90 (PL)= Schriftliche Prüfung (90 Minuten)
Seminar Molecular Modelling: EX (PL)
Praktikum Molecular Modelling: LAB (PL)
Berechnung der Modulnote: W90 (PL) 50% + EX (PL) 25% + LAB (PL) 25%
- Prüfungssprache: Deutsch
- Erstablegung: SS 2023, 1. Wdh.: SS 2023
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