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Python for Bioinformatics and Data Analysis (ILS-MA-B14)7.5 ECTS (englische Bezeichnung: Python für Bioinformatik und Datenanalyse)
(Prüfungsordnungsmodul: Python for bioinformatics and data analysis)
Modulverantwortliche/r: Rainer Böckmann Lehrende:
Rainer Böckmann
Startsemester: |
SS 2022 | Dauer: |
1 Semester | Turnus: |
jährlich (SS) |
Präsenzzeit: |
90 Std. | Eigenstudium: |
135 Std. | Sprache: |
Englisch |
Lehrveranstaltungen:
Inhalt:
Python Basics:
Introduction to modern scripting language Python and Jupyter Notebooks for creating code and visualizations; Data structures, conditions, branching, loops, functions, numpy, scipy, matplotlib libraries
Applications in Data Analysis:
handling of data and image files, visualization of data for publication, regression & correlation analysis, hypothesis testing, image analysis
Applications in Bioinformatics:
sequence alignments, RNA-Seq/Gene expression data analysis, NGS data, use of Protein Data Bank, processing of super-resolution image data
Lernziele und Kompetenzen:
The students
understand basic concepts of Python programming and Linux shell
acquire problem-oriented programming skills using Python
apply basic Python libraries in data analysis and bioinformatics
solve and implement simple application problems
Literatur:
- Lecture notes
Jupyter Notebooks
Verwendbarkeit des Moduls / Einpassung in den Musterstudienplan:
- Integrated Life Sciences: Biology, Biomathematics, Biophysics (Master of Science)
(Po-Vers. 2019w | NatFak | Integrated Life Sciences: Biology, Biomathematics, Biophysics (Master of Science) | Module Groups | MG3: Biological Structures and Processes | Mandatory Elective Modules Group 3 | Python for bioinformatics and data analysis)
Dieses Modul ist daneben auch in den Studienfächern "Zell- und Molekularbiologie (Master of Science)" verwendbar. Details
Studien-/Prüfungsleistungen:
Python for bioinformatics and data analysis (Prüfungsnummer: 20621)
- Prüfungsleistung, mehrteilige Prüfung, benotet, 7.5 ECTS
- Anteil an der Berechnung der Modulnote: 100.0 %
- weitere Erläuterungen:
- project work
presentation
- Erstablegung: SS 2022
1. Prüfer: | Rainer Böckmann |
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UnivIS ist ein Produkt der Config eG, Buckenhof |
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