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Orientierungsmodul Biochemie III: Einführung in die Sequenzanalyse (BCMA III)7.5 ECTS (englische Bezeichnung: BCMA III: Introduction to sequence analysis)
Modulverantwortliche/r: Stephan Reinert Lehrende:
Stephan Reinert, Uwe Sonnewald
Startsemester: |
SS 2022 | Dauer: |
1 Semester | Turnus: |
jährlich (SS) |
Präsenzzeit: |
120 Std. | Eigenstudium: |
105 Std. | Sprache: |
Deutsch |
Lehrveranstaltungen:
Inhalt:
- Einführung in Sequenzanalysen und Sequenzformate
Genomstrukturen
Analyse von Gensequenzen
Genetische Marker (SNPs und INDELs)
Next Generation Sequencing (NGS)
Genomkartierung und Genomannotation
Populationsgenetische Analysen
Genetische Kartierung
Erstellung analytischer Pipelines
Lernziele und Kompetenzen:
Die Studierenden
kennen und sind in der Lage verschiedene Datenbanken und Sequenzanalyse-Software zu auf eine Fragestellung anzuwenden
können Programme zum Vergleich von Sequenzen anwenden (BLAST)
sind in der Lage verschiedene NGS-Methoden zu beschreiben sowie Vor- und Nachteile dieser Methoden zu erklären
können genetische Marker mittels bioinformatischer Methoden identifizieren
sind in der Lage NGS-Daten zu analysieren
können Assoziationsanalysen durchführen (Interaktion von Phänotyp- und Genotyp-Daten)
können analytische Pipelines erstellen, welche eine schrittweise Analyse von NGS-Daten erlauben
sind zur Bearbeitung von einem eigenen Datensatz in einem hypothetischen Projekt befähigt
sind in der Lage eine Präsentation sowie einen wissenschaftlichen Bericht zu erstellen, welche die Ergebnisse aus dem hypothetischen Projekt diskutieren und in Zusammenhang mit Ergebnissen aus verschiedenen wissenschaftlichen Publikationen setzen.
Verwendbarkeit des Moduls / Einpassung in den Musterstudienplan: Das Modul ist im Kontext der folgenden Studienfächer/Vertiefungsrichtungen verwendbar:
- Zell- und Molekularbiologie (Master of Science)
(Po-Vers. 2008 | NatFak | Zell- und Molekularbiologie (Master of Science) | alte Prüfungsordnungen | Mastermodule | Biologische Mastermodule | BCMA III: Introduction to Sequence Analysis)
- Zell- und Molekularbiologie (Master of Science)
(Po-Vers. 2015w | NatFak | Zell- und Molekularbiologie (Master of Science) | Mastermodule | Biologische Mastermodule | BCMA III: Introduction to Sequence Analysis)
- Zell- und Molekularbiologie (Master of Science)
(Po-Vers. 2019w | NatFak | Zell- und Molekularbiologie (Master of Science) | Orientierungsmodule | Biologische Orientierungsmodule | BCMA III: Introduction to Sequence Analysis)
Studien-/Prüfungsleistungen:
BCMA III: Introduction to Sequence Analysis (Prüfungsnummer: 22802)
(englischer Titel: BCMA III: Introduction to sequence analysis)
- Prüfungsleistung, mehrteilige Prüfung, benotet, 7.5 ECTS
- Anteil an der Berechnung der Modulnote: 100.0 %
- weitere Erläuterungen:
SL: wissenschaftliche Präsentation (20 min)
PL: mündliche Prüfung (30 min)
PL: schriftlicher Bericht (ca. 10 – 20 Seiten)
Berechnung der Note 30% mündliche Prüfung, 70% schriftlicher Bericht
- Erstablegung: SS 2022
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