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Bioinformatik (Einfuehrung Bioinf)5 ECTS (englische Bezeichnung: Bioinformatics)
Modulverantwortliche/r: Heinrich Sticht Lehrende:
Heinrich Sticht
Startsemester: |
SS 2020 | Dauer: |
1 Semester | Turnus: |
jährlich (SS) |
Präsenzzeit: |
45 Std. | Eigenstudium: |
105 Std. | Sprache: |
Deutsch |
Lehrveranstaltungen:
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Grundlagen der Bioinformatik
(Vorlesung, 2 SWS, Heinrich Sticht, Mi, 10:00 - 12:00, 01.014)
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Übung Bioinformatik
(Übung, 3 SWS, Heinrich Sticht, Do, 9:15 - 12:00, 01.030 CIP Pool; Beginn nach Vereinbarung)
Inhalt:
- Quellen für Sequenzdaten und Sequenzdatenbanken
Proteinähnlichkeit und Proteinevolution
Kriterien zur Bewertung der Proteinähnlichkeit
Methoden zum paarweisen Sequenzvergleich
Algorithmen für schnelle Datenbanksuchen
Sekundäre Datenbanken
Multiples Sequenzalignment
Grundlagen von Proteinstrukturen
Vergleich von Proteinstrukturen
Sekundärstrukturvorhersage
Vorhersage von Proteinstrukturen
Lernziele und Kompetenzen:
Die Studierenden
kennen und nachvollziehen elementare Fragestellungen und wesentliche Grundlagen der Bioinformatik
kennen die Standardwerkzeuge zum Durchführen von Sequenzvergleichen, zur Suche in Sequenzdatenbanken und zur Sekundärstrukturvorhersage
wählen geeignete Werkzeuge und Parameter zur Bewertung der entsprechenden Ergebnisse und zum Erkennen möglicher Fehler aus
kennen und bewerten elementare bioinformatische Verfahren zur Strukturvorhersage und Strukturanalyse
wenden die mathematischen und statistischen Grundlagen der Verfahren an
können geeignete bioinformatische Verfahren zur Bearbeitung molekularbiologischer Fragen selbständig auswählen
Literatur:
Literatur auf der (passwortgeschützten) Webseite http://www.biochem.uni-erlangen.de/studium/index.php unter „Downloads Bioinformatik“ verfügbar
Verwendbarkeit des Moduls / Einpassung in den Musterstudienplan: Das Modul ist im Kontext der folgenden Studienfächer/Vertiefungsrichtungen verwendbar:
- Life Science Engineering (Bachelor of Science)
(Po-Vers. 2019w | TechFak | Life Science Engineering (Bachelor of Science) | Gesamtkonto | Bioinformatik)
- Life Science Engineering (Master of Science)
(Po-Vers. 2007 | TechFak | Life Science Engineering (Master of Science) | alte Prüfungsordnungen | Gesamtkonto | Ergänzungsmodule | Bioinformatik)
- Life Science Engineering (Master of Science)
(Po-Vers. 2015w | TechFak | Life Science Engineering (Master of Science) | Gesamtkonto | Ergänzungsmodule | Bioinformatik)
Studien-/Prüfungsleistungen:
Bioinformatik (Prüfungsnummer: 20501)
(englischer Titel: Bioinformatics)
- Prüfungsleistung, Klausur, Dauer (in Minuten): 45, benotet, 5 ECTS
- Anteil an der Berechnung der Modulnote: 100.0 %
- Erstablegung: SS 2020, 1. Wdh.: WS 2020/2021
1. Prüfer: | Heinrich Sticht |
- Termin: 22.07.2020, 10:30 Uhr, Ort: Hörsaal Biochemie, Fahrstr. 17
Termin: 14.07.2021
Termin: 09.02.2022, 10:00 Uhr, Ort: Fahrstr. 17, Inst. für Biochemie, Raum 01.030
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