| SFB 796, TP A4: Automatische multi-dimensionale Bildanalyse für die Fluoreszenzmikroskopie Noch keine Projektbeschreibung vorhanden | Projektleitung:
PD Dr.-Ing. Thomas Wittenberg
Beteiligte:
Christian Held, Veit Wiesmann, Franz Daniela, Dach Claudia
Stichwörter:
Fluoreszenzmikroskopie; Bildsegmentierung; Optimierung
Laufzeit: 1.1.2009 - 31.12.2016
Förderer:
Deutsche Forschungsgemeinschaft
Mitwirkende Institutionen:
Fraunhofer Institut für Integrierte Schaltungen IIS
Kontakt:
Wittenberg, Thomas
Telefon 09131/85-25396, Fax 09131/85-29931, E-Mail: thomas.wittenberg@fau.de
| | Publikationen |
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Held, Christian ; Nattkemper, Tim ; Palmisano, Ralf ; Wittenberg, Thomas: Approaches to automatic parameter fitting in a microscopy image segmentation pipeline: An exploratory parameter space analysis. In: J Pathol Inform 4 (2013), Nr. 5
[doi>10.4103/2153-3539.109831] | Held, Christian ; Wenzel, Jens ; Wiesmann, Veit ; Palmisano, Ralf ; Lang, Roland ; Wittenberg, Thomas: Enhancing automated micrograph-based evaluation of LPS-stimulated macrophage spreading. In: Cytometry A 83 (2013), Nr. 4, S. 409-18
[doi>10.1002/cyto.a.22248] | | Wiesmann, Veit ; Sauer, Tobias ; Held, Christian ; Palmisano, Ralf ; Wittenberg, Thomas: Cell Simulation for Validation of Cell Micrograph Evaluation Algorithms. In: DGBMT ; Dössel, Olaf (Hrsg.) : Biomedical Engineering / Biomedizinische Technik. (Biomedical Engineering / Biomedizinische Technik. Graz 19.-21.9.2013). Bd. 58 (Suppl. 1). Berlin : DeGruyter, 2013, S. online. (Biomedical Engineering / Biomedizinische Technik.) | | Franz, Daniela ; Wiesmann, Veit ; Stamminger, Marc ; Wittenberg, Thomas: Cell-Shape Wizard – A Concept for User-Guidance for Active Shape Segmentation in Fluorescence Cell Micrographs. In: Biomedical Engineering / Biomedizinische Technik 59 (2014), Nr. s1, S. 877-880 | | Wiesmann, Veit ; Bergler, Matthias ; Palmisano, Ralf ; Prinzen, Martin ; Franz, Daniela ; Wittenberg, Thomas: Enhanced Fluorescent Cell Simulation using Texture Mapping and Statistical Shape Model. In: Biomedical Engineering / Biomedizinische Technik 59 (2014), Nr. s1, S. S964-S967 | | Franz, Daniela ; Hofer, Mathias ; Pfeifle, Matthias ; Pirlich, Markus ; Stamminger, Marc ; Wittenberg, Thomas: A Wizard-Based Segmentation Approach for Cochlear Implant Planning. In: BVM (Hrsg.) : Informatik Aktuell (Bildverarbeitung für die Medizin Aachen 16.-18.3.2014). Heidelberg : Springer, 2014, S. 258-263. | Krappe, Sebastian ; Benz, Michaela ; Wittenberg, Thomas ; Haferlach, Torsten ; Münzenmayer, Christian: Automated classification of bone marrow cells in microscopic images for diagnosis of leukemia: A comparison of two classification schemes with respect to the segmentation quality. In: Proc. SPIE 9414, Medical Imaging 2015: Computer-Aided Diagnosis (Hrsg.) : Proc. SPIE 9414, (Medical Imaging 2015: Computer-Aided Diagnosis Orlando Feb. 21 - 26, 2015). Bd. 9414. 2015. - ISBN 9781628415049
[doi>10.1117/12.2081946] | Wiesmann, Veit ; Reimer, Dorothea ; Franz, Daniela ; Hüttmayer, Hanna ; Mielenz, Dirk ; Wittenberg, Thomas: Automated high-throughput analysis of B cell spreading on immobilized antibodies with whole slide imaging. In: Current Directions in Biomedical Engineering (2015), Nr. 1, S. 224–227
[doi>10.1515/CDBME-2015-0056] | Krappe, Sebastian# ; Münzenmayer, Christian ; Evert, Amrei ; Koyuncu, Can ; Cetin, Enis ; Haferlach, Torsten ; Wittenberg, Thomas ; Held, Christian: Dynamic programming for the segmentation of bone marrow cells. In: Handels, Heinz ; Deserno, Thomas ; Meinzer, Hans-Peter ; Tolxdorff, Thomas (Hrsg.) : Bildverarbeitung für die Medizin 2015 (Bildverarbeitung für die Medizin 2015 Lübeck 15.-17.3.2015). Heidelberg : Springer, 2015, S. 359-364. (Informatik Aktuell) - ISBN 978-3-662-46223-2
[doi>10.1007/978-3-662-46224-9_62] | | Franz, Daniela ; Syré, Liane ; Bischoff, Barbara ; Hastreiter, Peter ; Wittenberg, Thomas: Preoperative Planning of Neurovascular Compression Syndrome Surgery based on an Interactive Wizard-Based Segmentation Approach – Extended Evaluation Results. In: Hahn, Horst K. ; Kikinis, Ron ; Klein, Jan ; Nabavi, Arya ; Weber, Stefan (Hrsg.) : 2015 CURAC -Tagungsband (14. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Computer- und Roboterassistierte Chirurgie e.V. Bremen 17.-19.9.2015). 1. Aufl. 2015, S. 295-200. - ISBN 978-3-00-050359-7 | Wiesmann, Veit ; Franz, Daniela ; Held, Christian ; Münzenmayer, Christian ; Palmisano, Ralf ; Wittenberg, Thomas: Review of free software tools for image analysis of fluorescence cell micrographs. In: Journal of Microscopy (2015), Nr. 257, S. 39–53
[doi>10.1111/jmi.12184] | | Franz, Daniela ; Huettmayer, Hanna ; Stamminger, Marc ; Wiesmann, Veit ; Wittenberg, Thomas: The Cell-Shape-Wizard - User Guidance for Active Contour-based Cell Segmentation. In: BVM (Hrsg.) : Bildverarbeitung in der Medizin (BVM 2015 Lübeck 15.-17.03.2015). 2015, S. to appear. | Franz, Daniela ; Syré, Liane ; Paulus, Dietrich ; Bischoff, Barbara ; Wittenberg, Thomas ; Hastreiter, Peter: The SIP-NVC-Wizard. In: Handels, Heinz ; Deserno, Thomas ; Meinzer, Hans-Peter ; Tolxdorff, Thomas (Hrsg.) : Bildverarbeitung für die Medizin 2015 (Bildverarbeitung für die Medizin 2015 Lübeck 15.-17.3.2015). Heidelberg : Springer, 2015, S. 65-70. (Informatik Aktuell) - ISBN 978-3-662-46223-2
[doi>10.1007/978-3-662-46224-9_13] |
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