Retrospektive MikroskopieDie Herstellung histologischer Schnitte ist ein übliches
Verfahren, um
auf zellularer Ebene Gewebe und Gewebeänderungen zu
untersuchen.
Manchmal wäre es allerdings von Vorteil, wenn die
zugrundeliegende
drei-dimensionale (3-D) Struktur ebenfalls betrachtet
werden könnte, um
beispielsweise morphologische Merkmale besser zu
erkennen. Das Ziel dieses Projekts ist die 3-D Rekonstruktion von
histologischen
Datensätzen, wobei die Untersuchung und Implementierung
folgender
Schritte notwendig ist:
Schnitte
Reduzierung von Artefakten
Starre und nicht-starre Registrierung der Schnitte
Segmentierung relevanter Strukturen
Speicherung und Darstellung des 3-D Volumens
Das Projekt beschäftigt sich vorwiegend mit der
Rekonstruktion des
Sehnervenkopfs. Dieser ist bei einigen Augenerkrankungen
wie Glaukom von
besonderem Interesse. Strukturelle Änderungen in dieser
Region sollen
durch Rekonstruktion leichter und besser erfasst und
erforscht werden. Des Weiteren werden die Möglichkeiten einer Kombination
von
rekonstruierten histologischen Datensätzen mit Volumina
anderer
bildgebender Modalitäten, z.B. OCT, untersucht.
| Projektleitung: Prof. Dr.-Ing. Joachim Hornegger, Prof. Dr. med. Elke Lütjen-Drecoll, Prof. Dr. med. Friedrich Paulsen
Beteiligte: Simone Gaffling, M. Sc.
Stichwörter: Mikroskopie; 3-D Rekonstruktion; Histologie; Morphologie
Laufzeit: 1.7.2008 - 28.2.2014
Förderer: SAOT School of Advanced Optical Technologies
Kontakt: Gaffling, Simone Telefon +49 9131 85 27874, Fax +49 9131 85 27270, E-Mail: simone.gaffling@cs.fau.de
| Publikationen |
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Gaffling, Simone ; Jäger, Florian ; Daum, Volker ; Tauchi, Miyuki ; Lütjen-Drecoll, Elke: Interpolation of Histological Slices by Means of Non-rigid Registration. In: Meinzer, Hans-Peter ; Deserno, Thomas Martin ; Handels, Heinz ; Tolxdorff, Thomas (Hrsg.) : Bildverarbeitung für die Medizin 2009 (Bildverarbeitung für die Medizin 2009 Heidelberg 22.03.09 - 25.03.09). Berlin : Springer, 2009, S. 267-271. - ISBN 978-3-540-93859-0 | Gaffling, Simone: A Framework for fast 3-D Histomorphometric Reconstructions.Vortrag: The Association for Research in Vision and Ophthalmology, Inc. (ARVO) (Annual Meeting), The Association for Research in Vision and Ophthalmology, Inc. (ARVO), Fort Lauderdale, USA, 05.05..2010 | Gaffling, Simone ; Daum, Volker ; Hornegger, Joachim: Landmark-constrained 3-D Histological Imaging: A Morphology-preserving Approach. In: Eisert, Peter ; Hornegger, Joachim ; Polthier, Konrad (Hrsg.) : VMV 2011: Vision, Modeling & Visualization (16th International Workshop on Vision, Modeling and Visualization 2011 Berlin 04-06.10.2011). Goslar, Germany : Eurographics Association, 2011, S. 309-316. - ISBN 978-3-905673-85-2 [doi>10.2312/PE/VMV/VMV11/309-316] | Henker, Robert ; Scholz, Michael ; Gaffling, Simone ; Asano, Nagayoshi ; Hampel, Ulrike ; Garreis, Fabian ; Hornegger, Joachim ; Paulsen, Friedrich: Morphological Features of the Porcine Lacrimal Gland and Its Compatibility for Human Lacrimal Gland Xenografting. In: PLoS one 8 (2013), Nr. 9, S. e74046 [doi>10.1371/journal.pone.0074046] |
Institution: Lehrstuhl für Informatik 5 (Mustererkennung)
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