COSIRCOSIR - Combination of Chemical-Optical Sensors and Image
RecognitionDie Überwachung von Zellkulturen wird bis jetzt meist durch
einzelne
Messungen durchgeführt, die in bestimmten Zeitabständen
erfolgen. Zustände
zwischen diesen bekannten Zeitpunkten müssen daraus
abgeleitet werden.
Zudem finden diese Messungen unter Eingriffnahme in die
Zellkultur (z.B.
Probenahme) statt, was bei empfindlichen Zellen zu
ungewollten Effekten
führen kann. Das Ziel von COSIR ist es, ein System zur kontinuierlichen
Überwachung von
Zellkulturen zu entwickeln, das zudem ohne Probenahme und
äußere Einflüsse
Daten über das aktuelle Zellwachstum liefern kann. Dieses System wird in kompakter Bauweise verschiedene
optische und
chemische Sensoren und Aufnahmesysteme enthalten. Die
aufgenommenen
Signale werden mit Hilfe von Bildverarbeitungsmethoden
aufbereitet und
ausgewertet, um automatisch quantitative (z.B. Zellenanzahl)
als auch
qualitative Werte (z.B. Sauerstoffgehalt) zu liefern. Es soll universell einsetzbar sein, zur Expansion tierischer
Zellen,
Medienoptimierung oder Toxizitätstests. Der hauptsächliche
Nutzen wird
hierbei in der pharmazeutischen Entwicklung neuer
Medikamente, der
wissenschaftlichen Forschung, sowie in der Toxizitätsprüfung
liegen.
| Projektleitung: Dr. Gernot John
Beteiligte: Simone Gaffling, M. Sc., Dr.-Ing. Simon Schöll, Dipl.-Ing. Björn Sommerfeldt, Dr.-Ing. Firas Mualla
Stichwörter: Zellkultur; Online-Überwachung; chemisch-optische Sensoren; Bildverarbeitung
Laufzeit: 1.1.2011 - 31.12.2013
Förderer: Bayerische Forschungsstiftung
| Publikationen |
---|
Mualla, Firas ; Schöll, Simon ; Sommerfeldt, Björn ; Maier, Andreas ; Hornegger, Joachim: Automatic Cell Detection in Bright-Field Microscope Images Using SIFT, Random Forests, and Hierarchical Clustering. In: IEEE Transactions on Medical Imaging 32 (2013), Nr. 12, S. 2274-2286 [doi>10.1109/TMI.2013.2280380] | Mualla, Firas ; Schöll, Simon ; Sommerfeldt, Björn ; Hornegger, Joachim: Using the Monogenic Signal for Cell-Background Classification in Bright-Field Microscope Images. In: Meinzer, Hans-Peter ; Deserno, Thomas Martin (Hrsg.) : Proceedings des Workshops Bildverarbeitung für die Medizin 2013 (Bildverarbeitung für die Medizin 2013 Heidelberg 03.03.2013). Heidelberg : Springer, 2013, S. 170-174. |
Institution: Chair of Computer Science 5 (Pattern Recognition)
|
|