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Project Magnetic Resonance Imaging sequence programming (MRIpulseq)

Lecturers
Prof. Dr.-Ing. habil. Andreas Maier, Prof. Dr. rer. nat. Moritz Zaiß

Details
Praktikum
, benoteter certificate, ECTS studies, ECTS credits: 5, Sprache Deutsch oder Englisch
Time and place: Mon, Tue, Wed, Thu, Fri 9:30 - 17:30, room tbd; comments on time and place: Die Veranstaltung findet online statt (weitere Informationen s. StudOn-Link).
from 14.9.2020 to 25.9.2020

ECTS information:
Title:
Project Magnetic Resonance Imaging sequence programming

Credits: 5

Prerequisites
Voraussetzung für die Übung sind Kenntnisse entsprechend der Vorlesung Magnetic Resonance Imaging 1 [MRI1] von Prof. Dr. Laun. Auskunft: moritz.zaiss@uk-erlangen.de Anmeldung auf Studon unter: https://www.studon.fau.de/crs2819947.html

Contents
In dieser praktischen Übung werden die Grundlagen der MR Sequenzprogrammierung vermittelt. Grundlegende Sequenzen wie FID, Spinecho, und Gradientenecho werden in dieser Übung von den Studierenden selbst in Python programmiert. Zudem wird auch die grundlegende Bildrekonstruktion anhand der simulierten und aufgenommenen Daten in Python geschrieben und ausgeführt, bis hin zu radialer Bildgebung und iterativer Rekonstruktion. Die Sequenzen werden in einem Format erstellt, welches direkt von MR Scannern interpretierbar ist (https://pulseq.github.io), Teil der Übung wird daher sein die erstellten Sequenzen an einem realen MRT Gerät im Zentrum für Medizinische Physik und Technik einzusetzen und Signale von Gegenständen und Probanden zu erzeugen und zu MRT-Bildern zu rekonstruieren. Grundlegende Kenntnisse in Python sind hilfreich, können aber auch in der Übung erworben werden.

Für die praktische Übung werden 2.5 ECTS Übung vergeben, für praktische Übung inklusive Selbststudium-Projekt mit Vorführung in der Folgewoche zusammen 5 ECTS Punkte.

Additional information
Expected participants: 20, Maximale Teilnehmerzahl: 20
www: https://www.studon.fau.de/crs2819947.html

Department: Chair of Computer Science 5 (Pattern Recognition)
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