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Bioinformatik (Einfuehrung Bioinf)5 ECTS (englische Bezeichnung: Bioinformatics)
(Prüfungsordnungsmodul: Bioinformatik)
Modulverantwortliche/r: Heinrich Sticht Lehrende:
Heinrich Sticht
Start semester: |
SS 2016 | Duration: |
1 semester | Cycle: |
jährlich (SS) |
Präsenzzeit: |
45 Std. | Eigenstudium: |
105 Std. | Language: |
Deutsch |
Lectures:
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Grundlagen der Bioinformatik
(Vorlesung, 2 SWS, Heinrich Sticht, Wed, 10:15 - 12:00, Hörsaal Physiologie 2)
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Übung Bioinformatik
(Übung, 1 SWS, Heinrich Sticht et al., every 2. week Wed, 8:15 - 10:00, In. f. Biochemie Med. Fak.; CIP-Pool)
Inhalt:
- Quellen für Sequenzdaten und Sequenzdatenbanken
Proteinähnlichkeit und Proteinevolution
Kriterien zur Bewertung der Proteinähnlichkeit
Methoden zum paarweisen Sequenzvergleich
Algorithmen für schnelle Datenbanksuchen
Sekundäre Datenbanken
Multiples Sequenzalignment
Grundlagen von Proteinstrukturen
Vergleich von Proteinstrukturen
Sekundärstrukturvorhersage
Vorhersage von Proteinstrukturen
Lernziele und Kompetenzen:
Die Studierenden
kennen und nachvollziehen elementare Fragestellungen und wesentliche Grundlagen der Bioinformatik
kennen die Standardwerkzeuge zum Durchführen von Sequenzvergleichen, zur Suche in Sequenzdatenbanken und zur Sekundärstrukturvorhersage
wählen geeignete Werkzeuge und Parameter zur Bewertung der entsprechenden Ergebnisse und zum Erkennen möglicher Fehler aus
kennen und bewerten elementare bioinformatische Verfahren zur Strukturvorhersage und Strukturanalyse
wenden die mathematischen und statistischen Grundlagen der Verfahren an
können geeignete bioinformatische Verfahren zur Bearbeitung molekularbiologischer Fragen selbständig auswählen
Literatur:
Literatur auf der (passwortgeschützten) Webseite http://www.biochem.uni-erlangen.de/studium/index.php unter „Downloads Bioinformatik“ verfügbar
Verwendbarkeit des Moduls / Einpassung in den Musterstudienplan:
- Life Science Engineering (Master of Science)
(Po-Vers. 2015w | TechFak | Life Science Engineering (Master of Science) | Ergänzungsmodule | Bioinformatik)
Studien-/Prüfungsleistungen:
Bioinformatik
(englischer Titel: Bioinformatics)
- Prüfungsleistung, Klausur, benotet, 5 ECTS
- Anteil an der Berechnung der Modulnote: 100.0 %
- Erstablegung: SS 2016, 1. Wdh.: WS 2016/2017
1. Prüfer: | Heinrich Sticht |
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