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  Optical Technologies in Life Science (OTLS)

Lecturers
Dr. rer. nat. Sebastian Schürmann, Akad. Rat, Prof. Dr.med.habil. Dr.rer.nat. Dipl.-Phys. Oliver Friedrich, Prof. Dr. med. Maximilian Waldner, Dr.-Ing. Lucas Kreiß

Details
Vorlesung mit Übung
Online
4 cred.h, ECTS studies, ECTS credits: 5
nur Fachstudium, Sprache Englisch
Zeit: Tue 10:15 - 13:00, SR 00.030

Fields of study
WPF MT-MA-GPP 1-3
WPF LSE-MA 1-3
WPF AOT-GL 1-3
WPF CE-MA-TA-PO ab 1

Prerequisites / Organisational information
Kombinierte Vorlesung & Übung im Umfang von 4 SWS.
Schriftliche Prüfung (120 min.)

Empfohlene Voraussetzungen: Grundkenntnisse in den Bereichen Optik und Zellbiologie

Anmeldung über StudOn erforderlich.

Contents
Themen:
  • Anwendungen optischer Messmethoden im Bereich der Zellbiologie und Medizin

  • Mikroskopie: Grundlegende Konzepte und Kontrastverfahren, Auflösungsvermögen und Grenzen, Aufbau und Komponenten von Lichtmikroskopen, Fluoreszenz-Mikroskopie

  • Anwendungen von Fluoreszenz-Mikroskopie im Life Science Bereich, Verfahren zur Markierung biologischer Strukturen und Vorgänge in Zellen

  • Epifluoreszenz-, Konfokal-, Multiphotonen-Mikroskopie, Konzepte und Anwendungsbeispiele

  • Optische Endoskopie und Endomikroskopie in Forschung und Klinik

  • Super-Resolution Mikroskopie, Konzepte und Anwendungsbeispiele für optische Bildgebung jenseits der beugungsbedingten Auflösungsgrenze

Lernziele und Kompetenzen:

Die Studierenden

  • verstehen die grundlegenden Konzepte und technische Umsetzung optischer Technologien im Bereich Life Sciences und kennen typische Anwendungsbeispiele

  • können verschiedene technische Ansätze im Hinblick auf wissenschaftlich Fragestellungen vergleichen und bewerten

  • können Vor- und Nachteile verschiedener Technologien, sowie konzeptionelle und praktische Limitationen einschätzen und bei der Analyse wissenschaftlicher Ansätze und Ergebnisse berücksichtigen

  • können selbstständig vertiefende Informationen zu technischen Lösungen, Materialien und Methoden im Bereich der Mikroskopie und Spektroskopie sammeln, strukturieren, und für die zielgerichtete Planung wissenschaftlicher Experimente auswählen

  • können wissenschaftliche Fragestellungen und technische Ansätze in Kleingruppen kritisch diskutieren und gemeinschaftlich Ansätze zur Beantwortung von Forschungsfragen mit Hilfe optischer Technologien entwickeln

Recommended literature
  • Michael W. Davidson et al: Microscopy Primer, http://micro.magnet.fsu.edu, umfassendes Online-Lehrwerk über grundlegende Mikroskopieverfahren und neueste technische Entwicklungen
  • Bruce Alberts: Molecular Biology of the Cell, 4th Edition, New York, Garland Science Publisher. Standardlehrwerk für die Zellbiologie.

  • Ulrich Kubitschek: Fluorescence Microscopy: from Principles to Biological Applications, Wiley-VCH Verlag.

  • Douglas Chandler & Robert Roberson: Bioimaging: Current Concepts in Light and Electron Microscopy, Jones and Bartlett Publishers.

ECTS information:
Title:
Optical Technologies in Life Science

Credits: 5

Prerequisites
Combined lecture and exercise (4 SWS).
Written exam (120 min.)

Basic knowledge in optics and cell biology is recommended.

Please Register to the course via StudOn

Contents
Content
  • Application of optical methods in the field of cell biology and medicine

  • Microscopy: Basic concepts, methods to enhance contrast, optical resolution and limits, components and setup of light microscopes, fluorescence microscopy

  • Applications of fluorescence microscopy in life sciences, methods for labeling of biological structures and cellular processes´

  • Epi-fluorescence, confocal and multiphoton microscopy, concepts and application examples

  • Optical endoscopy and endomicroscopy in research and clinics

  • Super-resolution microscopy, concepts and applications for optical Imaging beyond the diffraction Limit of Resolution

Learning objectives and competences:
Students

  • understand the basic concepts and specific technical approaches to optical technologies in life sciences and identify typical applications examples.

  • can analyze and compare different technical approaches to scientific research questions.

  • can summarize advantages and disadvantages of different technologies and assess theoretical and practical limitations with regard to experimental approaches and results.

  • can find, collect and structure in-depth information on technical solutions, materials and methods in the areas of microscopy and spectroscopy, in order to plan scientific experiments.

Literature
  • Michael W. Davidson, Florida State University: Optical Microscopy Primer. http://micro.magnet.fsu.edu/primer/ . Comprehensive online learning resource from basic microscopy to the most recent technologic advances an application.
  • Bruce Alberts: Molecular Biology of the Cell, 4th Edition, New York, Garland Science Publisher. Reference textbook for the biology of the cell.

  • Ulrich Kubitschek: Fluorescence Microscopy: from Principles to Biological Applications, Wiley-VCH Verlag

  • Douglas Chandler & Robert Roberson: Bioimaging:Current Concepts in Light and Electron Microscopy, Jones and Bartlett Publishers.

Additional information
Expected participants: 40, Maximale Teilnehmerzahl: 40
www: http://www.mbt.tf.uni-erlangen.de

Verwendung in folgenden UnivIS-Modulen
Startsemester WS 2021/2022:
Optical Technologies in Life Science (OTLS)

Department: Chair of Medical Biotechnology
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