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Charakterisierung membranbindender Domänen von Proteinen, die mit Aktin assoziiert sind

Gegenstand der Untersuchung soll die funktionelle Charakterisierung membranbindender Epitope von Zytoskelettproteinen sein. Es gibt Hinweise, dass ARP (actin-related proteins) bei Zytosevorgängen und während des intrazellulären Vesikeltransports entweder direkt oder als Multiproteinkomplex mit der Plasma- oder Vesikelmembran assoziiert sind. Wie diese Bindung aussieht und über welche Bindungsdomänen sie erfolgt, ist bisher weder bekannt noch untersucht.
Ziel ist es, das ARP-Protein aus Thrombozyten zu isolieren und mittels auf Fluoreszenz basierender, hydrophober Markierungstechnik zu untersuchen. Membranbindende Sequenzen sollen anschließend als Peptide synthetisiert oder als GST-Fusionsproteine in Bakterien expremiert werden. Ihre Rekonstruktion in Membranmodellen soll dann unter Anwendung biophysikalischer Techniken eindeutig beschrieben werden.
Project manager:
Prof. Wolfgang Goldmann, Ph.D.

Project participants:
Dipl.-Biochem. Gerold Diez, Dipl.-Biol. Anna Klemm, Vitali Schewkunow

Keywords:
funktionelle Charakterisierung membranbindender Epitope von Zytoskelettproteinen; Isolierung des ARP (actin-related protein) Proteins aus Thrombozyten ; Synthetisierung membranbindender Sequenzen als Peptide oder Expremierung als GST-Fusionsproteine

Duration: 1.6.2005 - 31.12.2007

Sponsored by:
DFG

Mitwirkende Institutionen:
Massachusetts General Hospital, Boston, USA

Publications
Goldmann, Wolfgang ; Isenberg, G: Actin-related protein (Arp2) inserts into artificial lipid membranes. In: Cell Biol Int 26 (2002), pp 1073-1078
Scott, DL ; Diez, Gerold ; Goldmann, Wolfgang: Protein-lipid interactions: correlation of a predictive algorithm for lipid-binding sites with three-dimensional structural data.. In: Theoret. Biol. and Med. Modelling 3 (2006), No. 17, pp 1-14
Smith, J ; Diez, Gerold ; Klemm, Anna ; Schewkunow, V ; Goldmann, Wolfgang: CapZ-lipid membrane interactions: a computer analysis.. In: Theoret. Biol. and Med. Modelling 3 (2006), No. 30, pp 1-7

Institution: Lehrstuhl für Biophysik (Prof. Dr. Fabry)
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