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Bioinformatik (Einfuehrung Bioinf)5 ECTS
(englische Bezeichnung: Bioinformatics)
(Prüfungsordnungsmodul: Bioinformatik)

Modulverantwortliche/r: Heinrich Sticht
Lehrende: Heinrich Sticht


Start semester: SS 2018Duration: 1 semesterCycle: jährlich (SS)
Präsenzzeit: 45 Std.Eigenstudium: 105 Std.Language: Deutsch

Lectures:


Inhalt:

  • Quellen für Sequenzdaten und Sequenzdatenbanken
  • Proteinähnlichkeit und Proteinevolution

  • Kriterien zur Bewertung der Proteinähnlichkeit

  • Methoden zum paarweisen Sequenzvergleich

  • Algorithmen für schnelle Datenbanksuchen

  • Sekundäre Datenbanken

  • Multiples Sequenzalignment

  • Grundlagen von Proteinstrukturen

  • Vergleich von Proteinstrukturen

  • Sekundärstrukturvorhersage

  • Vorhersage von Proteinstrukturen

Lernziele und Kompetenzen:

Die Studierenden

  • kennen und nachvollziehen elementare Fragestellungen und wesentliche Grundlagen der Bioinformatik

  • kennen die Standardwerkzeuge zum Durchführen von Sequenzvergleichen, zur Suche in Sequenzdatenbanken und zur Sekundärstrukturvorhersage

  • wählen geeignete Werkzeuge und Parameter zur Bewertung der entsprechenden Ergebnisse und zum Erkennen möglicher Fehler aus

  • kennen und bewerten elementare bioinformatische Verfahren zur Strukturvorhersage und Strukturanalyse

  • wenden die mathematischen und statistischen Grundlagen der Verfahren an

  • können geeignete bioinformatische Verfahren zur Bearbeitung molekularbiologischer Fragen selbständig auswählen

Literatur:

Literatur auf der (passwortgeschützten) Webseite http://www.biochem.uni-erlangen.de/studium/index.php unter „Downloads Bioinformatik“ verfügbar


Verwendbarkeit des Moduls / Einpassung in den Musterstudienplan:

  1. Life Science Engineering (Master of Science)
    (Po-Vers. 2015w | TechFak | Life Science Engineering (Master of Science) | Ergänzungsmodule | Bioinformatik)

Studien-/Prüfungsleistungen:

Bioinformatik (Prüfungsnummer: 20501)

(englischer Titel: Bioinformatics)

Prüfungsleistung, Klausur, Dauer (in Minuten): 45, benotet, 5 ECTS
Anteil an der Berechnung der Modulnote: 100.0 %

Erstablegung: SS 2018, 1. Wdh.: WS 2018/2019
1. Prüfer: Heinrich Sticht
Termin: 11.07.2018, 10:15 Uhr
Termin: 06.02.2019, 10:15 Uhr, Ort: Hörsaal Physiologie, Waldstr. 6
Termin: 05.02.2020, 10:15 Uhr, Ort: Raum 01.030, Inst. für Biochemie, Fahrstr. 17

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