Computational Biology (ILS-W1)15 ECTS
(englische Bezeichnung: Computational Biology)

Lehrveranstaltungen:

• • ILS W1 Computational Biology
    (Vorlesung, Rainer Böckmann)
  • Übung ILS W1 Computational Biology
    (Übung, Vadym Aizinger et al., Mi, 16:00 - 18:00, Übung 3 / 01.252-128; vom 21.10.2015 bis zum 3.2.2016)

Inhalt:

Einführung in moderne Programmier-Sprachen und Simulations-Umgebungen:

• Programmierung in MATLAB (einschliesslich der Einbindung einfacher C++ Programme)

• Einführung in Diskretisierungs- und Lösungsverfahren für partielle Differentialgleichungen zur Beschreibung dynamischer Systeme

• Datenbankformate und Skript-Sprachen (PYTHON, PERL) in der Bioinformatik.

Simulation dynamischer Systeme am Beispiel aktueller biologischer Fragestellungen, z.B:

• Metabolische Flüsse

• Signaltransduktion und Transkriptions-regulatorische Netzwerke

• Zeitlich periodische Systeme

• Biologische Musterbildung

• Moleküldynamik

• Zellbewegung und morphogenetische Bewegungen

• Populationsgenetik und Evolutionsmodelle.
  

Lernziele und Kompetenzen:

Die Studierenden

• verfügen über vertiefte Kenntnisse wichtiger Programmier- und Simulationsumgebungen

• sind fähig aktuelle Simulationsmodelle in Computational Biology am Computer selbständig anzuwenden

• sind mit aktuellen Publikationen aus dem Bereich Computational Biology vertraut

• können die Inhalte aktueller Publikationen aus dem Lerngebiet diskutieren und hinterfragen

• verfügen über Kommunikationskompetenz.
  

Literatur:

Informationsmaterialien zur Vor- und Nachbereitung des Stoffes werden im Internet und als Kopien zur Verfügung gestellt.

Verwendbarkeit des Moduls / Einpassung in den Musterstudienplan:
Das Modul ist im Kontext der folgenden Studienfächer/Vertiefungsrichtungen verwendbar:

1. Informatik (Master of Science)
   (Po-Vers. 2010 | Nebenfach | Nebenfach Biologie | Wahlpflichtbereich | Computational Biology)
2. Integrated Life Sciences: Biologie, Biomathematik, Biophysik (Bachelor of Science)
   (Po-Vers. 2009 | Bachelorprüfung | Integrierte Wahlpflichtmodule | Computational Biology)

Studien-/Prüfungsleistungen:

Klausur Computational Biology (Teil 1) (Prüfungsnummer: 32702)

Prüfungsleistung, Klausur, Dauer (in Minuten): 45, benotet

Anteil an der Berechnung der Modulnote: 50.0 %

Erstablegung: WS 2015/2016, 1. Wdh.: SS 2016

1. Prüfer:

Rainer Böckmann

Termin: 25.02.2016, 10:00 Uhr, Ort: 01.178
Termin: 10.04.2017, 10:00 Uhr, Ort: SR Biologie (U1.850)

Klausur Computational Biology II (Prüfungsnummer: 32703)

Prüfungsleistung, Klausur, Dauer (in Minuten): 90, benotet

Anteil an der Berechnung der Modulnote: 50.0 %

Erstablegung: WS 2015/2016, 1. Wdh.: SS 2016

1. Prüfer:

Vadym Aizinger