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  Visual Computing in Medicine 1 (VCMed1)

Lecturers
PD Dr.-Ing. Peter Hastreiter, PD Dr. Thomas Wittenberg

Details
Vorlesung
2 cred.h, certificate, ECTS studies, ECTS credits: 2,5
nur Fachstudium, Sprache Deutsch, vormals "Analyse und Visualisierung medizinischer Bilddaten" (AnVisMed)
Time and place: Wed 10:15 - 11:45, EE 0.135

Fields of study
WPF MT-BA 5
WF TM-BA ab 4
WF TM-MA ab 1
WPF INF-BA-W ab 4
WPF CE-BA-TW ab 4
WPF CE-MA-INF ab 1
WPF INF-BA-S ab 4
WF IuK-BA ab 4
WPF IuK-MA ab 1
WPF MT-MA 1
WPF MT-BA-S 6

Prerequisites / Organisational information
Fachstudium / Erwerb eines Scheins nach mündlicher Prüfung

Contents
Die Flut und Komplexität medizinischer Bilddaten sowie die klinischen Anforderungen an Genauigkeit und Effizienz erfordern leistungsfähige wie auch robuste Konzepte der medizinischen Datenverarbeitung. Auf Grund der Vielfalt an Bildinformation und ihrer klinischen Relevanz spielt der Übergang von der Messung medizinischer Bilddaten (u.a. MRT, CT, PET) hin zur Analyse der Bildinhalte eine wichtige Rolle. Durch die visuelle Wiedergabe der abstrakten Daten können sowohl technische als auch medizinische Aspekte anschaulich und intuitiv verstanden werden.
Aufbauend auf einem Regelkreis zur Verarbeitung medizinischer Bilddaten werden die Eigenschaften medizinischer Bilddaten sowie grundlegende Methoden und Verfahren der medizinischen Bildanalyse und Visualisierung im Zusammenhang vermittelt. Beispiele aus der Praxis erläutern den Bezug zur medizinischen Anwendung.
  • Überblick zu bildgebenden Verfahren in der Medizin

  • Gitterstrukturen, Datentypen und Formate

  • Vorverarbeitung, Filterung und Interpolation

  • Grundlegende Ansätze zur Segmentierung

  • Explizite und implizite Methoden der Registrierung

  • Medizinische Visualisierung (2D, 3D, 4D) von Skalar-, Vektor-, Tensordaten

  • Praktische Demonstrationen in der Klinik und den Laboren

Recommended literature
  • B. Preim, D. Bartz: Visualization in Medicine - Theory, Algorithms, and Applications, Morgan Kaufmann Verlag, 2007
  • H. Handels: Medizinische Bildverarbeitung, Bildanalyse, Mustererkennung und Visualisierung für die computerge-stützte ärztliche Diagnostik und Therapie, Vieweg und Teubner Verlag, 2009

  • Th. Lehmann, W. Oberschelp, E. Pelikan, R. Pepges: Bildverarbeitung für die Medizin, Springer Verlag, 1997

  • P.M. Schlag, S. Eulenstein, Th. Lange: Computerassis-tierte Chirurgie, Elsevier Verlag, 2010

  • E. Neri, D. Caramella, C. Bartolozzi: Image Processing in Radiology, Springer Verlag, 2008

ECTS information:
Title:
Visual Computing in Medicine 1

Credits: 2,5

Prerequisites
Special Study, ECTS (2.5)

Contents
The flood and complexity of medical image data as well as the clinical need for accuracy and efficiency require powerful and robust concepts of medical data processing. Due to the diversity of image information and their clinical relevance the transition from imaging to medical analysis and interpretation plays an important role. The visual representation of abstract data allows understanding both technical and medical aspects in a comprehensive and intuitive way.
Based on a processing pipeline for medical image data an overview of the characteristics of medical image data as well as fundamental methods and procedures for medical image analysis and visualization is given. Examples of clinical practice show the relation to the medical application.
  • Overview of imaging techniques in medicince

  • Grid structures, data types, image formats

  • Preprocessing, filtering and interpolation

  • Fundamental approaches of segmentation

  • Explicit and implicit methods of registration

  • Medical visualization (2D, 3D, 4D) of scalar-, vector-, tensor data

  • Practical demonstrations in the labs and in the clinics

Literature
  • B. Preim, D. Bartz: Visualization in Medicine - Theory, Algorithms, and Applications, Morgan Kaufmann Verlag, 2007
  • H. Handels: Medizinische Bildverarbeitung, Bildanalyse, Mustererkennung und Visualisierung für die computerge-stützte ärztliche Diagnostik und Therapie, Vieweg und Teubner Verlag, 2009

  • Th. Lehmann, W. Oberschelp, E. Pelikan, R. Pepges: Bildverarbeitung für die Medizin, Springer Verlag, 1997

  • P.M. Schlag, S. Eulenstein, Th. Lange: Computerassis-tierte Chirurgie, Elsevier Verlag, 2010

  • E. Neri, D. Caramella, C. Bartolozzi: Image Processing in Radiology, Springer Verlag, 2008

Additional information
Keywords: Medizinische Visualisierung (Medical imaging), Segmentierung (Segmentation), Registrierung (Registration)
Expected participants: 20
www: http://www9.informatik.uni-erlangen.de/Teaching

Verwendung in folgenden UnivIS-Modulen
Startsemester WS 2012/2013:
Visual Computing in Medicine (VCMed1)
Visual Computing in Medicine (VCMed)

Department: Chair of Computer Science 9 (Computer Graphics)
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